1农业防治
通过科学合理的栽培措施，对辣椒的生长环境进行控制，能在一定程度上预防病虫害的发生。如及时清理辣椒的生长环境，保持种植地的清洁;在选择辣椒品种时，充分考虑到抗病虫害能力;避免连作，尽可能做到轮作、间作，减少土壤中有害微生物和害虫的累积。
2化学防治
2.1常见病虫害的防治措施
(1)疫病
温水浸种，用1%硫酸铜溶液浸种5分钟，栽植后用硫酸铜溶液喷洒或灌根。植株生长前期掌握在发病前，喷洒植株茎基地表，防止初侵染；生长中后期以田间喷雾为主，防止再侵染。
(2)灰霉病
可用50%扑海因可湿性粉剂1500倍液、60%多菌灵超微粉600倍液或50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液+50%扑海因可湿性粉剂2000倍液，每667平米喷药液50 升，隔7~10天喷1次，视病情连续防治2~3次。
(3)碎倒病
多见于苗期，可用75%敌克松1000倍液灌根，或用70%甲基托布津1 000倍液喷雾或灌根。
(4)蚜虫
可选用80%的敌敌畏乳油800~1000倍液或20%速灭杀丁2000~3000倍液或10%氯氰菊醋2500~3000
倍液或康福多7000倍液、艾美乐1g/667平米进行防治。
2.2注意事项
化学防治的主要方式为喷施化学农药，优势在于见效快、效果好，但容易产生农药残留，对环境造成污染和破坏。因此，在选择化学农药时，要尽可能选择残留量较少、毒性较小以及对标靶外生物无危害的化学农药，并且严格按照标准进行施用。
3物理防治
物理方法防治病虫害可以有效减少化学农药的施用，降低病虫危害。在播种前，对种子进行消毒处理，减
少病虫害滋生的可能性;用塑料棚膜提高地温，灭杀土壤中的有害生物;人为调控保护地小生境的温湿度，抑制某些病菌的生长等。
利用遮阳网、防虫网等，可以减轻蚜传病毒病的发生。利用蚜虫、白粉虱喜黄色，蚜虫忌避银灰色的特性，在田间铺银灰膜或悬挂银灰膜条避蚜，采用黄板或黄皿诱杀蚜虫和白粉虱。
4生物防治
随着农业种植技术的进步，病虫害生物防治技术已经越来越成熟。生物防治主要利用生物链上相克关系通过引人昆虫和生物农药等方法，利用昆虫和有益的微生物快速防治辣椒病虫害，减少化学农药污染，实施绿色生产。
4.1引人天敌
引人天敌是利用昆虫觅食的天性，引进以有害生物为食的昆虫，例如释放丽蚜小蜂或草岭等捕杀白粉虱，人工饲养瓢虫、蜘蛛、草岭等防治蚜虫。
4.2喷施生物农药
利用细菌杀虫剂(Bt乳剂、HD-1等苏云金芽饱杆菌制剂)或棉铃虫核型多角体病毒制剂等来防治棉铃虫。另外，根瘤菌的菌丝也可以杀死病原物中的有害物质，抑制病菌的繁殖和病原物的活性，其对土壤中的病原物作用很强，并有促进辣椒生长的作用。
